Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk13Q69ZA1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms