Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE8

Znf280d, Zinc finger protein 280D, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf280dQ68FE8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Znf280dQ68FE8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf280dQ68FE8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms