Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CilpQ66K08 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CilpQ66K08 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms