Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q66JV7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q66JV7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q66JV7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q66JV7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q66JV7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q66JV7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q66JV7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q66JV7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q66JV7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q66JV7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q66JV7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q66JV7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q66JV7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Q66JV7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q66JV7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q66JV7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q66JV7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q66JV7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q66JV7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q66JV7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q66JV7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q66JV7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q66JV7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q66JV7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q66JV7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q66JV7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q66JV7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q66JV7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q66JV7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q66JV7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q66JV7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q66JV7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q66JV7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q66JV7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q66JV7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q66JV7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q66JV7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q66JV7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q66JV7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q66JV7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q66JV7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Q66JV7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q66JV7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q66JV7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q66JV7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q66JV7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q66JV7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q66JV7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q66JV7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q66JV7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q66JV7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q66JV7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Q66JV7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q66JV7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q66JV7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q66JV7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q66JV7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q66JV7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q66JV7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q66JV7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q66JV7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q66JV7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q66JV7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q66JV7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q66JV7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q66JV7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q66JV7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q66JV7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q66JV7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q66JV7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q66JV7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q66JV7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q66JV7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q66JV7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q66JV7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q66JV7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q66JV7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q66JV7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q66JV7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q66JV7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q66JV7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q66JV7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q66JV7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q66JV7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q66JV7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q66JV7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q66JV7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q66JV7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q66JV7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q66JV7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q66JV7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q66JV7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q66JV7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q66JV7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q66JV7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q66JV7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q66JV7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q66JV7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q66JV7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms