Protein–RNA interactions for Protein: Q64336

Tbr1, T-box brain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbr1Q64336 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tbr1Q64336 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tbr1Q64336 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tbr1Q64336 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tbr1Q64336 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tbr1Q64336 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tbr1Q64336 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tbr1Q64336 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Tbr1Q64336 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tbr1Q64336 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Tbr1Q64336 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tbr1Q64336 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tbr1Q64336 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tbr1Q64336 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tbr1Q64336 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tbr1Q64336 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tbr1Q64336 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tbr1Q64336 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tbr1Q64336 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tbr1Q64336 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tbr1Q64336 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tbr1Q64336 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tbr1Q64336 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tbr1Q64336 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tbr1Q64336 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tbr1Q64336 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tbr1Q64336 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tbr1Q64336 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tbr1Q64336 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tbr1Q64336 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tbr1Q64336 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tbr1Q64336 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tbr1Q64336 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tbr1Q64336 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tbr1Q64336 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tbr1Q64336 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tbr1Q64336 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tbr1Q64336 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Tbr1Q64336 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tbr1Q64336 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tbr1Q64336 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tbr1Q64336 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Tbr1Q64336 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Tbr1Q64336 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tbr1Q64336 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Tbr1Q64336 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Tbr1Q64336 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Tbr1Q64336 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Tbr1Q64336 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Tbr1Q64336 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Tbr1Q64336 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tbr1Q64336 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Tbr1Q64336 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tbr1Q64336 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tbr1Q64336 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tbr1Q64336 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tbr1Q64336 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tbr1Q64336 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tbr1Q64336 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tbr1Q64336 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tbr1Q64336 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tbr1Q64336 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tbr1Q64336 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tbr1Q64336 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tbr1Q64336 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tbr1Q64336 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tbr1Q64336 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Tbr1Q64336 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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