Protein–RNA interactions for Protein: Q64253

Ly6e, Lymphocyte antigen 6E, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6eQ64253 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ly6eQ64253 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6eQ64253 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6eQ64253 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6eQ64253 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6eQ64253 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6eQ64253 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6eQ64253 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6eQ64253 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6eQ64253 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6eQ64253 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6eQ64253 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6eQ64253 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6eQ64253 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6eQ64253 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6eQ64253 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6eQ64253 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6eQ64253 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6eQ64253 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6eQ64253 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6eQ64253 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6eQ64253 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6eQ64253 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6eQ64253 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6eQ64253 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6eQ64253 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6eQ64253 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ly6eQ64253 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6eQ64253 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6eQ64253 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6eQ64253 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6eQ64253 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6eQ64253 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6eQ64253 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6eQ64253 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6eQ64253 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6eQ64253 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6eQ64253 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6eQ64253 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6eQ64253 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6eQ64253 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6eQ64253 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6eQ64253 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ly6eQ64253 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms