Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf1Q64213 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf1Q64213 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf1Q64213 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf1Q64213 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf1Q64213 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf1Q64213 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf1Q64213 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sf1Q64213 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sf1Q64213 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms