Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CcncQ62447 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CcncQ62447 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CcncQ62447 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CcncQ62447 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CcncQ62447 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.8 ms