Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tpd52Q62393 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tpd52Q62393 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms