Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Ttf1Q62187 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ttf1Q62187 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ttf1Q62187 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Ttf1Q62187 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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