Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rbm38Q62176 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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