Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
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PtprrQ62132 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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PtprrQ62132 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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PtprrQ62132 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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PtprrQ62132 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PtprrQ62132 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PtprrQ62132 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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PtprrQ62132 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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PtprrQ62132 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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PtprrQ62132 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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PtprrQ62132 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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PtprrQ62132 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PtprrQ62132 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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PtprrQ62132 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms