Protein–RNA interactions for Protein: Q61878

Prg2, Bone marrow proteoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg2Q61878 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg2Q61878 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms