Protein–RNA interactions for Protein: Q61818

Rai1, Retinoic acid-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai1Q61818 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rai1Q61818 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rai1Q61818 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms