Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gli3Q61602 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gli3Q61602 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms