Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd53Q61451 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd53Q61451 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd53Q61451 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd53Q61451 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd53Q61451 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd53Q61451 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd53Q61451 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd53Q61451 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd53Q61451 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd53Q61451 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd53Q61451 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd53Q61451 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd53Q61451 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd53Q61451 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd53Q61451 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd53Q61451 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd53Q61451 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd53Q61451 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms