Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnna2Q61301 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms