Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1Q61056 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trpc1Q61056 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trpc1Q61056 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms