Protein–RNA interactions for Protein: Q61033

Tmpo, Lamina-associated polypeptide 2, isoforms alpha/zeta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmpoQ61033 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TmpoQ61033 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TmpoQ61033 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TmpoQ61033 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TmpoQ61033 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TmpoQ61033 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TmpoQ61033 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TmpoQ61033 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TmpoQ61033 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TmpoQ61033 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TmpoQ61033 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TmpoQ61033 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TmpoQ61033 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TmpoQ61033 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TmpoQ61033 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TmpoQ61033 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TmpoQ61033 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TmpoQ61033 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TmpoQ61033 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TmpoQ61033 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TmpoQ61033 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TmpoQ61033 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TmpoQ61033 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TmpoQ61033 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TmpoQ61033 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TmpoQ61033 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TmpoQ61033 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TmpoQ61033 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TmpoQ61033 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TmpoQ61033 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TmpoQ61033 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TmpoQ61033 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TmpoQ61033 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TmpoQ61033 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TmpoQ61033 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TmpoQ61033 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TmpoQ61033 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TmpoQ61033 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TmpoQ61033 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TmpoQ61033 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TmpoQ61033 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TmpoQ61033 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TmpoQ61033 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TmpoQ61033 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TmpoQ61033 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TmpoQ61033 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TmpoQ61033 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TmpoQ61033 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TmpoQ61033 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TmpoQ61033 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TmpoQ61033 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TmpoQ61033 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TmpoQ61033 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TmpoQ61033 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TmpoQ61033 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TmpoQ61033 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TmpoQ61033 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TmpoQ61033 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TmpoQ61033 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TmpoQ61033 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TmpoQ61033 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TmpoQ61033 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TmpoQ61033 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TmpoQ61033 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TmpoQ61033 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TmpoQ61033 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TmpoQ61033 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TmpoQ61033 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms