Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Neurod1Q60867 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Neurod1Q60867 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms