Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Klf4Q60793 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Klf4Q60793 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms