Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdkn2dQ60773 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms