Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprnQ60673 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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PtprnQ60673 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprnQ60673 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprnQ60673 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprnQ60673 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprnQ60673 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprnQ60673 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprnQ60673 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprnQ60673 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprnQ60673 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprnQ60673 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtprnQ60673 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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PtprnQ60673 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprnQ60673 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprnQ60673 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprnQ60673 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtprnQ60673 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtprnQ60673 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtprnQ60673 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtprnQ60673 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtprnQ60673 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtprnQ60673 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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PtprnQ60673 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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PtprnQ60673 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprnQ60673 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprnQ60673 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprnQ60673 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprnQ60673 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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PtprnQ60673 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprnQ60673 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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PtprnQ60673 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtprnQ60673 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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PtprnQ60673 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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PtprnQ60673 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprnQ60673 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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PtprnQ60673 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprnQ60673 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprnQ60673 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprnQ60673 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprnQ60673 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprnQ60673 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprnQ60673 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprnQ60673 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprnQ60673 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PtprnQ60673 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprnQ60673 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprnQ60673 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PtprnQ60673 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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PtprnQ60673 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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