Protein–RNA interactions for Protein: Q60604

Scin, Adseverin, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScinQ60604 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ScinQ60604 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ScinQ60604 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ScinQ60604 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ScinQ60604 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ScinQ60604 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ScinQ60604 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ScinQ60604 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ScinQ60604 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ScinQ60604 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms