Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rabl6Q5U3K5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rabl6Q5U3K5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms