Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Brip1Q5SXJ3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brip1Q5SXJ3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms