Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Myh1Q5SX40 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Myh1Q5SX40 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Myh1Q5SX40 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Myh1Q5SX40 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Myh1Q5SX40 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Myh1Q5SX40 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Myh1Q5SX40 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Myh1Q5SX40 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Myh1Q5SX40 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Myh1Q5SX40 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Myh1Q5SX40 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Myh1Q5SX40 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Myh1Q5SX40 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Myh1Q5SX40 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Myh1Q5SX40 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Myh1Q5SX40 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Myh1Q5SX40 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Myh1Q5SX40 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Myh1Q5SX40 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Myh1Q5SX40 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Myh1Q5SX40 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Myh1Q5SX40 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Myh1Q5SX40 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Myh1Q5SX40 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Myh1Q5SX40 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Myh1Q5SX40 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Myh1Q5SX40 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Myh1Q5SX40 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Myh1Q5SX40 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Myh1Q5SX40 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Myh1Q5SX40 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Myh1Q5SX40 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Myh1Q5SX40 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms