Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVL9

Prl2c1, Growth hormone d22, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prl2c1Q5SVL9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prl2c1Q5SVL9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prl2c1Q5SVL9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prl2c1Q5SVL9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prl2c1Q5SVL9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Prl2c1Q5SVL9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prl2c1Q5SVL9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prl2c1Q5SVL9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prl2c1Q5SVL9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prl2c1Q5SVL9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prl2c1Q5SVL9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prl2c1Q5SVL9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prl2c1Q5SVL9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prl2c1Q5SVL9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prl2c1Q5SVL9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prl2c1Q5SVL9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prl2c1Q5SVL9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prl2c1Q5SVL9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prl2c1Q5SVL9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prl2c1Q5SVL9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prl2c1Q5SVL9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms