Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf215Q5SPX3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf215Q5SPX3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms