Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bhlha9Q5RJB0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms