Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trdv2-2Q5R1A4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trdv2-2Q5R1A4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms