Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Scarf1Q5ND28 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scarf1Q5ND28 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms