Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Trim41Q5NCC3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Trim41Q5NCC3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Trim41Q5NCC3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Trim41Q5NCC3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Trim41Q5NCC3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Trim41Q5NCC3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Trim41Q5NCC3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Trim41Q5NCC3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Trim41Q5NCC3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Trim41Q5NCC3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Trim41Q5NCC3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trim41Q5NCC3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Trim41Q5NCC3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms