Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
1810065E05RikQ5NC41 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
1810065E05RikQ5NC41 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms