Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ttf2Q5NC05 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ttf2Q5NC05 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms