Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZH7

Slc38a8, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 8, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a8Q5HZH7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Slc38a8Q5HZH7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Slc38a8Q5HZH7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms