Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH62

Xkr9, XK-related protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xkr9Q5GH62 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xkr9Q5GH62 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xkr9Q5GH62 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xkr9Q5GH62 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xkr9Q5GH62 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xkr9Q5GH62 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Xkr9Q5GH62 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xkr9Q5GH62 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xkr9Q5GH62 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Xkr9Q5GH62 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xkr9Q5GH62 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms