Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWH3

Grhl3, Grainyhead-like protein 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grhl3Q5FWH3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grhl3Q5FWH3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grhl3Q5FWH3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grhl3Q5FWH3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Grhl3Q5FWH3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grhl3Q5FWH3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Grhl3Q5FWH3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Grhl3Q5FWH3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grhl3Q5FWH3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grhl3Q5FWH3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grhl3Q5FWH3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grhl3Q5FWH3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grhl3Q5FWH3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grhl3Q5FWH3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grhl3Q5FWH3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grhl3Q5FWH3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Grhl3Q5FWH3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grhl3Q5FWH3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Grhl3Q5FWH3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Grhl3Q5FWH3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grhl3Q5FWH3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grhl3Q5FWH3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Grhl3Q5FWH3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grhl3Q5FWH3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grhl3Q5FWH3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grhl3Q5FWH3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grhl3Q5FWH3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grhl3Q5FWH3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grhl3Q5FWH3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grhl3Q5FWH3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grhl3Q5FWH3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Grhl3Q5FWH3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grhl3Q5FWH3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Grhl3Q5FWH3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Grhl3Q5FWH3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms