Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sfmbt2Q5DTW2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms