Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rtl5Q5DTT4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rtl5Q5DTT4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms