Protein–RNA interactions for Protein: Q4VC17

Adamts18, A disintegrin and metalloproteinase with thrombospondin motifs 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Adamts18Q4VC17 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Adamts18Q4VC17 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Adamts18Q4VC17 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Adamts18Q4VC17 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Adamts18Q4VC17 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Adamts18Q4VC17 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Adamts18Q4VC17 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Adamts18Q4VC17 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Adamts18Q4VC17 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Adamts18Q4VC17 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Adamts18Q4VC17 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Adamts18Q4VC17 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Adamts18Q4VC17 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Adamts18Q4VC17 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Adamts18Q4VC17 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Adamts18Q4VC17 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Adamts18Q4VC17 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Adamts18Q4VC17 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Adamts18Q4VC17 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Adamts18Q4VC17 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Adamts18Q4VC17 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Adamts18Q4VC17 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Adamts18Q4VC17 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Adamts18Q4VC17 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Adamts18Q4VC17 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Adamts18Q4VC17 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Adamts18Q4VC17 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Adamts18Q4VC17 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Adamts18Q4VC17 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Adamts18Q4VC17 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Adamts18Q4VC17 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Adamts18Q4VC17 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Adamts18Q4VC17 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Adamts18Q4VC17 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Adamts18Q4VC17 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Adamts18Q4VC17 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms