Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA53

Pds5b, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pds5bQ4VA53 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Pds5bQ4VA53 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Pds5bQ4VA53 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pds5bQ4VA53 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pds5bQ4VA53 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pds5bQ4VA53 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Pds5bQ4VA53 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pds5bQ4VA53 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pds5bQ4VA53 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pds5bQ4VA53 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pds5bQ4VA53 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pds5bQ4VA53 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pds5bQ4VA53 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pds5bQ4VA53 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pds5bQ4VA53 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pds5bQ4VA53 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pds5bQ4VA53 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Pds5bQ4VA53 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pds5bQ4VA53 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pds5bQ4VA53 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Pds5bQ4VA53 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Pds5bQ4VA53 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pds5bQ4VA53 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pds5bQ4VA53 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pds5bQ4VA53 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pds5bQ4VA53 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pds5bQ4VA53 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pds5bQ4VA53 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pds5bQ4VA53 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pds5bQ4VA53 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pds5bQ4VA53 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pds5bQ4VA53 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pds5bQ4VA53 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms