Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trappc3lQ4KL14 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc3lQ4KL14 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms