Protein–RNA interactions for Protein: Q499D5

Zfp235, Zinc finger protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp235Q499D5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Zfp235Q499D5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Zfp235Q499D5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Zfp235Q499D5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp235Q499D5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms