Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Foxn3Q499D0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Foxn3Q499D0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms