Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Krt35Q497I4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krt35Q497I4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms