Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms