Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Garnl3Q3V0G7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Garnl3Q3V0G7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms