Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
4933416C03RikQ3V063 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933416C03RikQ3V063 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms