Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

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Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SvipQ3UZP4 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Gm45132-201ENSMUST00000207234 2542 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SvipQ3UZP4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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